《说文解字》
作者：东汉·许慎
《本草纲目》引用：散见各卷（如卷十四“当归”引《说文》释名）
《字林》
作者：晋·吕忱
《本草纲目》引用：散见释名部（如卷十五“艾”引《字林》考字义）
《六书正讹》
作者：元·周伯琦（注：原“周弼”为误记，实为周伯琦）
《本草纲目》引用：未明确引用
《说文本原》
作者：元·周伯琦
《本草纲目》引用：未明确引用
《字说》
作者：宋·王安石
《本草纲目》引用：卷十九“菰米”引其解字
《六书本义》
作者：明·赵撝谦（字古则）
《本草纲目》引用：未明确引用
《玉篇》
作者：南朝梁·顾野王
《本草纲目》引用：散见释名（如卷三十“梨”引《玉篇》释字形）
《唐韵》
作者：唐·孙愐
《本草纲目》引用：散见音释（如卷二十六“蒜”引《唐韵》注音）
《六书精蕴》
作者：明·魏校（字子才）
《本草纲目》引用：未明确引用
《仓颉解诂》
作者：三国魏·张揖（注：仓颉为托名，张揖辑注）
《本草纲目》引用：未明确引用
《集韵》
作者：宋·丁度等
《本草纲目》引用：散见音释（如卷十三“黄连”引《集韵》注音）
《古今韵会》
作者：宋·黄公绍（原误作“黄公武”），熊忠举要
《本草纲目》引用：卷十四“芎?”引其音义
《洪武正韵》
作者：明·乐韶凤等（官方修订）
《本草纲目》引用：散见音释（如卷一“凡例”引其注音规范）
《韵府群玉》
作者：元·阴时夫（阴幼遇）
《本草纲目》引用：卷四十八“雀”引其典故
《续韵府群玉》
作者：明·包瑜
《本草纲目》引用：未明确引用
《急就章》
作者：西汉·史游
《本草纲目》引用：卷三十八“帛”引其名物记载
《广雅》
作者：三国魏·张揖
《本草纲目》引用：散见释名（如卷三十九“蜂蜜”引《广雅》别名）
《尔雅正义》
作者：清·邵晋涵（注：孙炎作为汉魏学者，着有《尔雅注》，非《正义》）
《本草纲目》引用：误标，实际多引《尔雅》郭璞注（如卷四十“蠮螉”）
《小尔雅》
作者：汉·孔鲋（托名）
《本草纲目》引用：卷三十七“茯苓”引其训诂
《博雅》
作者：隋·曹宪（即《广雅》音释，唐避讳改称《博雅》）
《本草纲目》引用：同《广雅》
《尔雅翼》
作者：宋·罗愿
《本草纲目》引用：卷四十一“蜈蚣”引其形态描述
《方言》
作者：汉·扬雄
《本草纲目》引用：散见释名（如卷五十“豕”引方言称谓）
《埤雅》
作者：宋·陆佃
《本草纲目》引用：卷四十三“龙”引其释义
《埤雅广义》
作者：待考（或为宋·陆佃《埤雅》之误，《埤雅》专释动植物名物）
《本草纲目》引用：散见各卷（如卷四十“虫部·蜜蜂”引《埤雅》论蜂房）
《释名》
作者：东汉·刘熙
《本草纲目》引用：卷一卷二“序例”引释名训诂（如“病释名”部分）
《名苑》
作者：待考（或为宋·司马光《类篇》之误，司马光无《名苑》传世）
《毛诗草木鸟兽虫鱼疏》
作者：三国吴·陆玑
《本草纲目》引用：卷十五“草部·白蒿”等引陆玑疏释《诗经》植物
《禽经》
作者：旧题周·师旷（实为汉后伪托）
《本草纲目》引用：卷四十七“禽部·鹤”引《禽经》论鹤鸣
《禽虫述》
作者：明·袁达
《本草纲目》引用：未明确引用（或与《禽经》混淆）
《相鹤经》
作者：旧题汉·淮南八公（伪托）
《本草纲目》引用：卷四十七“禽部·鹤”引养生术
《兽经》
作者：明·黄省曾
《本草纲目》引用：卷五十一“兽部·虎”引述兽类习性
《蜂记》
作者：宋·王禹偁（字元之）
《本草纲目》引用：卷三十九“虫部·蜜蜂”引养蜂法
《贝经》《龟经》
作者：明·朱仲相
《本草纲目》引用：卷四十六“介部·贝子”引分类考
《质龟论》
作者：宋·张世南
《本草纲目》引用：卷四十五“介部·龟”引占卜术
《果然赋》
作者：三国魏·钟毓
《本草纲目》引用：卷五十一“兽部·果然”引猿类描述
《马经》
作者：待考（或指隋·诸葛颖《相马经》）
《本草纲目》引用：卷五十“兽部·马”引疗马方